Os motores elétricos quando em funcionamento aquecem. É um comportamento normal e não há o que fazer para que isso não ocorra. Mas podemos tentar manter a temperatura em níveis mais toleráveis ao componente. Várias são as possibilidades, como por exemplo, uma ventoinha sobre o motor. Funciona super bem. Eu mesmo tenho dois barcos que funcionam dessa forma.
Porém existem outras possibilidades e em se tratando de barcos podemos fazer o resfriamento do motor utilizando a água do local onde se está navegando. Basta instalar um tubo após a hélice. Dessa forma a hélice força a água a entrar por ele e é levada por mangueiras até uma serpentina. Essa serpentina fica em torno do motor, mantendo um contato físico. A serpentina pode ser de metal ou então de silicone. Nesse vídeo abaixo mostro a serpentina de silicone. A água depois de manter contato com o motor é então devolvida para o lago ou mar de onde ela foi retirada. Esse processo funciona super bem e já o vi implementado em diferentes embarcações.